Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC5P28715 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC5P28715 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms