Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SDSP20132 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SDSP20132 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SDSP20132 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SDSP20132 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SDSP20132 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SDSP20132 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SDSP20132 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SDSP20132 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SDSP20132 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SDSP20132 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SDSP20132 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SDSP20132 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SDSP20132 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SDSP20132 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SDSP20132 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SDSP20132 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SDSP20132 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SDSP20132 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SDSP20132 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SDSP20132 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SDSP20132 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SDSP20132 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SDSP20132 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SDSP20132 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SDSP20132 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SDSP20132 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SDSP20132 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SDSP20132 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SDSP20132 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SDSP20132 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SDSP20132 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SDSP20132 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SDSP20132 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SDSP20132 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SDSP20132 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SDSP20132 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SDSP20132 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SDSP20132 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SDSP20132 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SDSP20132 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SDSP20132 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SDSP20132 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SDSP20132 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SDSP20132 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SDSP20132 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SDSP20132 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SDSP20132 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SDSP20132 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDSP20132 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDSP20132 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDSP20132 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDSP20132 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDSP20132 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDSP20132 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDSP20132 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDSP20132 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDSP20132 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDSP20132 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDSP20132 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SDSP20132 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDSP20132 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDSP20132 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDSP20132 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDSP20132 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SDSP20132 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SDSP20132 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SDSP20132 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SDSP20132 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SDSP20132 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SDSP20132 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SDSP20132 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SDSP20132 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SDSP20132 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SDSP20132 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SDSP20132 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SDSP20132 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SDSP20132 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SDSP20132 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SDSP20132 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SDSP20132 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SDSP20132 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SDSP20132 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SDSP20132 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SDSP20132 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SDSP20132 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SDSP20132 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SDSP20132 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SDSP20132 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SDSP20132 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SDSP20132 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SDSP20132 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SDSP20132 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SDSP20132 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SDSP20132 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SDSP20132 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SDSP20132 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SDSP20132 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SDSP20132 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SDSP20132 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms