Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A1P19634 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC9A1P19634 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9A1P19634 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms