Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF35P13682 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF35P13682 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms