Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN2P0C2S0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN2P0C2S0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN2P0C2S0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN2P0C2S0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN2P0C2S0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN2P0C2S0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN2P0C2S0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN2P0C2S0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN2P0C2S0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN2P0C2S0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTXN2P0C2S0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms