Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC2P02585 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNC2P02585 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms