Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNAP02545 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNAP02545 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNAP02545 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNAP02545 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNAP02545 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNAP02545 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNAP02545 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNAP02545 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNAP02545 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNAP02545 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNAP02545 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNAP02545 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNAP02545 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNAP02545 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNAP02545 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNAP02545 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNAP02545 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNAP02545 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNAP02545 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNAP02545 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNAP02545 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNAP02545 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNAP02545 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNAP02545 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNAP02545 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNAP02545 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNAP02545 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNAP02545 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNAP02545 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNAP02545 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNAP02545 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNAP02545 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNAP02545 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNAP02545 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNAP02545 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNAP02545 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNAP02545 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNAP02545 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNAP02545 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNAP02545 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNAP02545 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNAP02545 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNAP02545 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNAP02545 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMNAP02545 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMNAP02545 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNAP02545 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNAP02545 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNAP02545 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNAP02545 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNAP02545 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNAP02545 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNAP02545 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNAP02545 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNAP02545 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNAP02545 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNAP02545 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNAP02545 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNAP02545 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNAP02545 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNAP02545 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNAP02545 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNAP02545 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNAP02545 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNAP02545 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNAP02545 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNAP02545 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNAP02545 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNAP02545 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNAP02545 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNAP02545 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNAP02545 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNAP02545 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNAP02545 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNAP02545 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNAP02545 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNAP02545 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNAP02545 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNAP02545 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNAP02545 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNAP02545 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNAP02545 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNAP02545 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNAP02545 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNAP02545 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNAP02545 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNAP02545 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNAP02545 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNAP02545 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNAP02545 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNAP02545 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNAP02545 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNAP02545 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNAP02545 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNAP02545 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNAP02545 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNAP02545 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNAP02545 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNAP02545 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms