Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED1O96006 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZBED1O96006 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED1O96006 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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