Protein–RNA interactions for Protein: O94761

RECQL4, ATP-dependent DNA helicase Q4, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4O94761 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQL4O94761 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQL4O94761 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms