Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOO75962 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIOO75962 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIOO75962 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIOO75962 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIOO75962 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIOO75962 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIOO75962 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIOO75962 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIOO75962 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOO75962 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOO75962 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOO75962 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOO75962 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOO75962 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOO75962 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOO75962 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOO75962 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOO75962 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOO75962 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOO75962 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOO75962 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOO75962 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOO75962 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOO75962 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIOO75962 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOO75962 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOO75962 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOO75962 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOO75962 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOO75962 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOO75962 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIOO75962 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIOO75962 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIOO75962 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIOO75962 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIOO75962 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIOO75962 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIOO75962 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIOO75962 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIOO75962 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIOO75962 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIOO75962 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIOO75962 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIOO75962 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIOO75962 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIOO75962 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIOO75962 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIOO75962 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIOO75962 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIOO75962 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIOO75962 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIOO75962 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIOO75962 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIOO75962 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIOO75962 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIOO75962 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIOO75962 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIOO75962 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIOO75962 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIOO75962 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIOO75962 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIOO75962 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIOO75962 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIOO75962 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIOO75962 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIOO75962 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIOO75962 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIOO75962 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIOO75962 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIOO75962 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIOO75962 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIOO75962 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIOO75962 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIOO75962 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIOO75962 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIOO75962 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIOO75962 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIOO75962 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIOO75962 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIOO75962 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIOO75962 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIOO75962 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIOO75962 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIOO75962 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIOO75962 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIOO75962 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIOO75962 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIOO75962 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIOO75962 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIOO75962 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIOO75962 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIOO75962 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIOO75962 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIOO75962 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIOO75962 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIOO75962 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIOO75962 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIOO75962 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIOO75962 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms