Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC47.05■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC47.04■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.03■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC47.03■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC47.02■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.02■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC47.01■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC47.01■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.01■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC47■■■■■ 5.12
ABCC9O60706 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC47■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC47■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC47■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC46.99■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC46.99■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC46.98■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC46.98■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC46.97■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC46.97■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC46.96■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC46.96■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.96■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC46.95■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC46.95■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.94■■■■■ 5.11
ABCC9O60706 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC46.94■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC46.94■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC46.93■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC46.93■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC46.93■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC46.93■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC46.92■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC46.92■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC46.91■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC46.9■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.9■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC46.89■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC46.89■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC46.88■■■■■ 5.1
ABCC9O60706 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC46.88■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC46.88■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC46.87■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC46.87■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC46.87■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC46.86■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC46.86■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC46.86■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.85■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.85■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC46.85■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
ABCC9O60706 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms