Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDB2O43679 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDB2O43679 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LDB2O43679 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDB2O43679 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDB2O43679 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LDB2O43679 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDB2O43679 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDB2O43679 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDB2O43679 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDB2O43679 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDB2O43679 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDB2O43679 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDB2O43679 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDB2O43679 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDB2O43679 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LDB2O43679 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDB2O43679 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDB2O43679 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDB2O43679 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDB2O43679 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDB2O43679 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDB2O43679 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDB2O43679 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDB2O43679 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDB2O43679 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDB2O43679 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDB2O43679 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDB2O43679 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDB2O43679 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDB2O43679 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LDB2O43679 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LDB2O43679 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LDB2O43679 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LDB2O43679 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LDB2O43679 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LDB2O43679 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LDB2O43679 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LDB2O43679 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LDB2O43679 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LDB2O43679 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LDB2O43679 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LDB2O43679 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LDB2O43679 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDB2O43679 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDB2O43679 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDB2O43679 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDB2O43679 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDB2O43679 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDB2O43679 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDB2O43679 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDB2O43679 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDB2O43679 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDB2O43679 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LDB2O43679 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDB2O43679 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDB2O43679 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDB2O43679 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LDB2O43679 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDB2O43679 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDB2O43679 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDB2O43679 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDB2O43679 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDB2O43679 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDB2O43679 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDB2O43679 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDB2O43679 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDB2O43679 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDB2O43679 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LDB2O43679 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDB2O43679 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDB2O43679 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDB2O43679 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDB2O43679 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDB2O43679 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDB2O43679 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDB2O43679 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDB2O43679 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDB2O43679 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDB2O43679 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDB2O43679 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDB2O43679 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LDB2O43679 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDB2O43679 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDB2O43679 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LDB2O43679 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LDB2O43679 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDB2O43679 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDB2O43679 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDB2O43679 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDB2O43679 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDB2O43679 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDB2O43679 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LDB2O43679 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDB2O43679 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDB2O43679 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDB2O43679 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDB2O43679 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDB2O43679 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDB2O43679 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms