Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENRO43583 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENRO43583 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENRO43583 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DENRO43583 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENRO43583 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENRO43583 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENRO43583 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DENRO43583 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DENRO43583 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENRO43583 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENRO43583 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENRO43583 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DENRO43583 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENRO43583 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENRO43583 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENRO43583 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENRO43583 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENRO43583 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENRO43583 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENRO43583 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENRO43583 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DENRO43583 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DENRO43583 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DENRO43583 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DENRO43583 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DENRO43583 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DENRO43583 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DENRO43583 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DENRO43583 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DENRO43583 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DENRO43583 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DENRO43583 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DENRO43583 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DENRO43583 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DENRO43583 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DENRO43583 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DENRO43583 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DENRO43583 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DENRO43583 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DENRO43583 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DENRO43583 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DENRO43583 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DENRO43583 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DENRO43583 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DENRO43583 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DENRO43583 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DENRO43583 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DENRO43583 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DENRO43583 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DENRO43583 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DENRO43583 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DENRO43583 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DENRO43583 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DENRO43583 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DENRO43583 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DENRO43583 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DENRO43583 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DENRO43583 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DENRO43583 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DENRO43583 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DENRO43583 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DENRO43583 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DENRO43583 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DENRO43583 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DENRO43583 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DENRO43583 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DENRO43583 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENRO43583 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENRO43583 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENRO43583 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENRO43583 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENRO43583 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENRO43583 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENRO43583 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENRO43583 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENRO43583 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DENRO43583 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENRO43583 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENRO43583 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENRO43583 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENRO43583 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENRO43583 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENRO43583 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENRO43583 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENRO43583 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENRO43583 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENRO43583 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENRO43583 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENRO43583 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENRO43583 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENRO43583 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENRO43583 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENRO43583 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENRO43583 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DENRO43583 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DENRO43583 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DENRO43583 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DENRO43583 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DENRO43583 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.3 ms