Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAPBPO15533 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAPBPO15533 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms