Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
IKBKBO14920 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IKBKBO14920 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IKBKBO14920 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms