Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4DGG1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4DGG1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4DGG1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4DGG1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4DGG1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4DGG1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4DGG1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4DGG1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4DGG1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
B4DGG1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4DGG1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4DGG1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4DGG1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4DGG1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4DGG1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4DGG1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4DGG1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4DGG1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
B4DGG1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4DGG1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4DGG1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4DGG1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DGG1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DGG1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DGG1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DGG1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DGG1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DGG1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DGG1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4DGG1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4DGG1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4DGG1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4DGG1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
B4DGG1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4DGG1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4DGG1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4DGG1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4DGG1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
B4DGG1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4DGG1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4DGG1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4DGG1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4DGG1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4DGG1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4DGG1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4DGG1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
B4DGG1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4DGG1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4DGG1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4DGG1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4DGG1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4DGG1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
B4DGG1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4DGG1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4DGG1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4DGG1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4DGG1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4DGG1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4DGG1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4DGG1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4DGG1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4DGG1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4DGG1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4DGG1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
B4DGG1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4DGG1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4DGG1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4DGG1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4DGG1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4DGG1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4DGG1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4DGG1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4DGG1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4DGG1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4DGG1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4DGG1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
B4DGG1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4DGG1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4DGG1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4DGG1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4DGG1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4DGG1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4DGG1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4DGG1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B4DGG1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B4DGG1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B4DGG1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B4DGG1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B4DGG1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B4DGG1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B4DGG1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B4DGG1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DGG1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DGG1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DGG1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DGG1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DGG1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DGG1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DGG1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms