Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB1P1B2RPK0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms