Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ARID3CA6NKF2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ARID3CA6NKF2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
ARID3CA6NKF2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARID3CA6NKF2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms