Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQA8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQA8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U3KQA8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U3KQA8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
U3KQA8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U3KQA8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U3KQA8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U3KQA8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U3KQA8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
U3KQA8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U3KQA8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U3KQA8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U3KQA8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U3KQA8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQA8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQA8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQA8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQA8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQA8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQA8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQA8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQA8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQA8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQA8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQA8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQA8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQA8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQA8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQA8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQA8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQA8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQA8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQA8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQA8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQA8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQA8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQA8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQA8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQA8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQA8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQA8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQA8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQA8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQA8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQA8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQA8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQA8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQA8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQA8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQA8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQA8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
U3KQA8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQA8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQA8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQA8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQA8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQA8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQA8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQA8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQA8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQA8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQA8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQA8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQA8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQA8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQA8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQA8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQA8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U3KQA8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U3KQA8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U3KQA8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U3KQA8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U3KQA8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQA8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQA8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQA8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQA8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQA8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQA8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQA8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQA8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQA8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQA8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQA8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQA8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQA8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQA8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQA8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQA8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQA8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQA8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQA8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQA8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQA8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQA8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQA8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQA8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQA8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQA8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms