Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC61Q9Y6R9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC61Q9Y6R9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC61Q9Y6R9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC61Q9Y6R9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms