Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHAC2Q9Y5I4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHAC2Q9Y5I4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms