Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COQ4Q9Y3A0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COQ4Q9Y3A0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COQ4Q9Y3A0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms