Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LEMD3Q9Y2U8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LEMD3Q9Y2U8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LEMD3Q9Y2U8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LEMD3Q9Y2U8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LEMD3Q9Y2U8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LEMD3Q9Y2U8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LEMD3Q9Y2U8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LEMD3Q9Y2U8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LEMD3Q9Y2U8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LEMD3Q9Y2U8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LEMD3Q9Y2U8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LEMD3Q9Y2U8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LEMD3Q9Y2U8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms