Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41L3Q9Y2J2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPB41L3Q9Y2J2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPB41L3Q9Y2J2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPB41L3Q9Y2J2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPB41L3Q9Y2J2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPB41L3Q9Y2J2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPB41L3Q9Y2J2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPB41L3Q9Y2J2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPB41L3Q9Y2J2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms