Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRPF3Q9ULD4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms