Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERG28Q9UKR5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms