Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZDHHC3Q9NYG2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms