Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPHK1Q9NYA1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPHK1Q9NYA1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms