Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHCHD3Q9NX63 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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