Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMSN1Q9NSI8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMSN1Q9NSI8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1567.4 ms