Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLCO1B3Q9NPD5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms