Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC40A1Q9NP59 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC40A1Q9NP59 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC40A1Q9NP59 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms