Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD2

MRPL9, 39S ribosomal protein L9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL9Q9BYD2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL9Q9BYD2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL9Q9BYD2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL9Q9BYD2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms