Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BBS2Q9BXC9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBS2Q9BXC9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms