Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM106CQ9BVX2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM106CQ9BVX2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms