Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SGIP1Q9BQI5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SGIP1Q9BQI5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms