Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYD88Q99836 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MYD88Q99836 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYD88Q99836 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms