Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LITAFQ99732 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LITAFQ99732 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LITAFQ99732 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms