Protein–RNA interactions for Protein: Q99217

AMELX, Amelogenin, X isoform, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMELXQ99217 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMELXQ99217 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMELXQ99217 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165 ms