Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HAPLN3Q96S86 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HAPLN3Q96S86 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms