Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCNAQ96QF7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNAQ96QF7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms