Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SYNGAP1Q96PV0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYNGAP1Q96PV0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNGAP1Q96PV0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms