Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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SAMD8Q96LT4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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SAMD8Q96LT4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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SAMD8Q96LT4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SAMD8Q96LT4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SAMD8Q96LT4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SAMD8Q96LT4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SAMD8Q96LT4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SAMD8Q96LT4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SAMD8Q96LT4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD8Q96LT4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD8Q96LT4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD8Q96LT4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD8Q96LT4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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SAMD8Q96LT4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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SAMD8Q96LT4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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SAMD8Q96LT4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD8Q96LT4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SAMD8Q96LT4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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SAMD8Q96LT4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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SAMD8Q96LT4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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SAMD8Q96LT4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
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SAMD8Q96LT4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMD8Q96LT4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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