Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00208Q96KT6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms