Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NEURL4Q96JN8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NEURL4Q96JN8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NEURL4Q96JN8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NEURL4Q96JN8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEURL4Q96JN8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEURL4Q96JN8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEURL4Q96JN8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEURL4Q96JN8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEURL4Q96JN8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEURL4Q96JN8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
NEURL4Q96JN8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NEURL4Q96JN8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NEURL4Q96JN8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NEURL4Q96JN8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEURL4Q96JN8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEURL4Q96JN8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEURL4Q96JN8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEURL4Q96JN8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEURL4Q96JN8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms