Protein–RNA interactions for Protein: Q96AP4

ZUFSP, Zinc finger with UFM1-specific peptidase domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZUFSPQ96AP4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZUFSPQ96AP4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ZUFSPQ96AP4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZUFSPQ96AP4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ZUFSPQ96AP4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZUFSPQ96AP4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZUFSPQ96AP4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms