Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SELENOMQ8WWX9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOMQ8WWX9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOMQ8WWX9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms