Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.5 ms