Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms