Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PPARGC1BQ86YN6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PPARGC1BQ86YN6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PPARGC1BQ86YN6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PPARGC1BQ86YN6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms